命运石之门结局几个？
目前两个，一个是游戏原版结局（即真结局），另一个是游戏改编的动画版结局。 由于游戏结局有剧透，所以下面只详细讲述动画版结局。 在游戏中，可以收集到6个钥匙碎片，分别对应6个不同的时间点，而集齐6个碎片后便可打开时间之门，回到过去改变历史。玩家可以自由选择回去改变历史的时机，只要避开已经知道的悲惨未来即可。也就是说，只要不回到悲剧发生的那个时间点，任何其他的选择都会导致一个新的大团圆的结局。（例如，先选择救美里，再选择让真由理死亡，这样真由理就不会失去活下去的希望而自杀，最后与桐人一起幸福生活下去） 而动画版的结局就是基于这个剧情设定的。在动漫中，男主多次回到了过去，试图拯救身边的人，但是每一次努力都失败了，每一次失败又导致了新的时间和宇宙的诞生…… 终于，在最后一次回归之前，男主明白了这个道理，他放弃了拯救真由理，而是选择了救赎自己——他杀死了想要杀死自己的真由理，让时光流逝，直到新的时间点到来。
到了新时间节点之后，一切都已经改变了，曾经的危险消失，真由理也没有了抑郁，她和桐人愉快的生活在一起，并且怀上了孩子；而男主也变成了一个很普通的少年，和青梅竹马的少女一起生活，每天上学，放学，做一些青春期的无聊事情，以及暗自神伤——因为男主知道，自己之所以能和一个普通女孩快乐幸福的生活着，是因为真由理牺牲了自己，用死亡换来了男主新生。
这个结局似乎和原版游戏结局差不多了，但是从女主的视角来看，却又是另外一个故事——真由理死后，女主一直生活在痛苦之中，她恨男主的不告而别，更后悔自己在生命最后的时刻对男主说的那些话（“我想和你在一起”等）伤了男主的心。于是，女主开始发奋图强，一心只想弄明白男主究竟是谁，他们两人之间的爱情究竟是怎样的存在。
经过不断的探索和钻研，女主流淌着眼泪，终于理解了男主的心意，也明白了男主所说的“我们的爱是永恒的”含义。 于是，女主亲自来到了时间之门前，将男主以前送她的项链插在了门旁，作为进入过去的凭证。接着，她穿越了时空，来到过去，找到了男主，两人拥抱在了一起。 看到这里，整部剧的结局已经不言而喻了。